Skip to content. | Skip to navigation

Sections
Workshop de Anotação Genômica
Personal tools
You are here: Home Programa do curso

Programa do curso

Data: 17 e 18 de Abril (terça e quarta) Horário: de 9:00 as 18:00h Local: Manhãs => Laboratório de informática LEP3, prédio da Decania do CCMN (em frente ao CT) Tardes => Sala de aula 530, bloco A, quinto andar, prédio do CT

O programa é preliminar e está sujeito a alterações.

É essencial que cada participante venha com seu laptop. Haverá ambiente wirelles acessível e cada participante receberá um pendrive com os principais programas a serem utilizados já instalados, de modo a simplificar o processo.

 

7 de Abril
9:00 - 9:30 Apresentação do workshop
9:30 - 10:00 Iniciando os laptops usando o pendrive bioinformático  
10:00 - 13:00 - | Identificando seu gene por blast online (site VB) e local
| Identificando sua família gênica por domínio conservado das proteínas preditas (software FAT)
13:00-14:00 almoço
14:00 - 15:00  Avaliando a integridade do gene por resultados de blast e no artemis (número de exons, regiões de splicing, start e stop codons)
15:00 - 16:00   Revisão de predição usando SIM4 (usando cDNA) e genewise (usando proteína homóloga) 
16:00 - 16:15 - café
16:15 - 18:00  Revisão manual de predição dos seus genes de interesse usando Artemis.
 
18 de Abril
09:00 -11:00 Editando os gffs no artemis para alterar os genes com predição modificada.
11:00 - 13:00   Anotando manualmente genes baseado em resultados de blast e domínio conservado (oriundos do FAT) e do anotador automático do Prof José Marcos.
13:00 - 14:00 almoço
14:00 - 16:00 Anotando manualmente genes baseado em resultados de blast e domínio conservado (oriundos do FAT) e do anotador automático do Prof José Marcos.
16:00 - 16:15 café
16:00 - 18:00   Gerando novos fastas e gffs (com anotação) no artemis no formato para submissão ao VB
Document Actions